Если будет ничья, игра продолжается всё дополнительное время (30 минут) вне зависимости от количества забитых голов. Если по истечении дополнительного времени всё ещё ничья, то победитель определяется с помощью серии послематчевых пенальти.

Он, наверное, имеет ввиду как будут рассчитываться очки...по результатом основного времени или с учётом дополнительного? К примеру я напишу счёт 1:0. В основное время игра завершится со счётом 0:0, а с учётом дополнительного времени будет 1:0. Сколько очков получу?

2. Ставки и начисление очков за угаданные матчи.
а. За правильный исход матча +3 очка;
б. За правильную угаданную разницу +1 очко;
в. За угаданный счет +2 очка.
г. За угаданный крупный счет при угаданном исходе матча (разница > 2 мячей) +1 очко.
д. За предсказание того, что матч закончится по пенальти +2 очка. (при наличии таковых матчей)
е. В случае, если игрок угадал исход матча и указал при ставке что матч закончился по пенальти, а этого не случилось, с игрока снимается 1 очко.
ж. При ничьей +1 очко.

Может имеет смысл добавить и доп бонусы за исход в дополнительное время?

Португалия 2-1 Чили
Германия 2-1 Мексика
+

Португалия 2:1 Чили
Германия 2:1 Мексика
+

полуфиналы:
29 июня
Португалия 1-1 Чили По пенальти проходит португалия
30 июня
Германия 2-2 Мексика По пенальти проходит германия
+

Полуфиналы:
29 июня
Португалия - Чили 1-2
30 июня
Германия - Мексика 1-1 в доп время 2-1
+

Португалия - Чили 2:1
Германия - Мексика 2:1

Португалия 1-2 Чили
Германия 1-2 Мексика